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技術(shù)文章

標(biāo)志物L(fēng)C3檢測(cè)時(shí)需要注意的5大要點(diǎn)

點(diǎn)擊次數(shù):3103   發(fā)布時(shí)間:2023/11/7 10:13:03

自噬(auhagy)是由 Ashford 和 Porter 在 1962 年發(fā)現(xiàn)細(xì)胞內(nèi)有“自己吃自己”的現(xiàn)象后提出的,是指從粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的無核糖體附著區(qū)脫落的雙層膜包裹部分胞質(zhì)和細(xì)胞內(nèi)需降解的細(xì)胞器、蛋白質(zhì)等成分形成自噬體(auhagosome),并與溶酶體融合形成自噬溶酶體,降解其所包裹的內(nèi)容物,以實(shí)現(xiàn)細(xì)胞本身的代謝需要和某些細(xì)胞器的更新。

自噬

自噬的功能

1.饑餓應(yīng)答時(shí)的作用,在不同的器官如肝臟或在培養(yǎng)細(xì)胞中,氨基酸的匱乏會(huì)誘導(dǎo)細(xì)胞產(chǎn)生自體吞噬,由自體吞噬分解大分子,產(chǎn)生在分解代謝和合成代謝過程中所必須的中間代謝物。

2.在細(xì)胞正;顒(dòng)中的作用,如在動(dòng)物的變態(tài)發(fā)育、老化和分化過程中,自體吞噬負(fù)責(zé)降解正常的蛋白以重新組建細(xì)胞。盡管通常人們認(rèn)為自體吞噬不具有選擇性,但是在某些病理和壓力條件下,通過自體吞噬能選擇性地隔離某些細(xì)胞器,如線粒體、過氧化物酶體等。

3.在某些組織中的特定功能,如黑質(zhì)的塞梅林神經(jīng)節(jié)中,多巴胺能神經(jīng)元中的神經(jīng)黑色素的合成就需要把細(xì)胞質(zhì)中的多巴胺醌用自噬囊泡包被隔離起來。

自噬過程的LC3

微管相關(guān)蛋白1輕鏈3 (LC3, MAP1LC3),是Atg8在哺乳動(dòng)物中的同源物。LC3/Atg8 被具有蛋白內(nèi)切酶活性的Atg4在羧基端剪切,生成胞漿型 LC3-I。在自噬形成時(shí),胞漿型LC3-I通過Atg7 和 Atg3(分別對(duì)應(yīng)泛素激活酶E1和泛素結(jié)合酶E2)參與的類泛素樣反應(yīng),使磷脂酰乙醇胺 (PE) 偶聯(lián),生成脂質(zhì)化形式的 LC3,也稱作 LC3-II,它附著到自噬體(auhagosome)的膜上,是自噬體的結(jié)構(gòu)蛋白,即自噬體膜型LC3-II。在降解過程中,位于自噬溶酶體外膜的LC3-II被半胱氨酸蛋白酶Atg4B切割,產(chǎn)生LC3-I循環(huán)利用;位于內(nèi)膜的LC3-II則與包裹的內(nèi)容物一起,被溶酶體降解。導(dǎo)致自噬溶酶體中LC3含量很低。

自噬過程的LC3

在哺乳動(dòng)物中,存在 4 種LC3異構(gòu)體(LC3A、LC3B、 LC3B2和 LC3C),在不同的組織細(xì)胞中表達(dá)會(huì)有差異。目主要研究的是LC3A和LC3B,LC3C在許多細(xì)胞中表達(dá)量很低,研究的也較少。其中每種異構(gòu)體都可以有I和II兩種亞型。

在進(jìn)行自噬研究時(shí),檢測(cè) LC3-I 和 LC3-II 幾乎是必做的實(shí)驗(yàn),利用Western Blot檢測(cè)LC3-II/I比值的變化以評(píng)價(jià)自噬形成。自噬形成時(shí),胞漿型LC3會(huì)酶解掉一小段多肽形成LC3-I,LC3-I跟PE結(jié)合轉(zhuǎn)變?yōu)椋ㄗ允审w)膜型(即LC3-II),因此LC3-II/I比值的大小可估計(jì)自噬水平的高低。那么,進(jìn)行 LC3 檢測(cè)時(shí),需要注意哪些要點(diǎn)呢?

1.需要知道樣本的LC3表達(dá)量和表達(dá)的種類。不表達(dá)或者表達(dá)量很低樣本,就不適合用于自噬的研究。使用LC3A或LC3B的抗體均可,使用LC3A/B抗體,同時(shí)檢測(cè)兩種,可以大大提高實(shí)驗(yàn)成功率。

2.LC3-I 和 II 存在一個(gè)生成-降解的動(dòng)態(tài)過程,所以單時(shí)間點(diǎn) LC3-II 的表達(dá)改變并不能體現(xiàn)自噬的改變,需要使用一些阻斷溶酶體降解的藥物(如氯喹、巴佛洛霉素 A1 等),判斷在干預(yù)手段下,細(xì)胞的自噬程度的改變。氯喹可以通過抑制溶酶體功能(比如升高它的 pH 值),抑制 LC3-II 的降解;巴佛洛霉素 A1 則是一種強(qiáng)效 V-ATPase 抑制劑,阻斷溶酶體依賴的降解。在「堵漏」的提下,根據(jù)一段時(shí)間內(nèi) LC3-II 的積聚程度,判斷自噬的改變。

3.目的 LC3 抗體所檢測(cè)的抗原表位都位于 LC3 的 N 端,由于 PE 基團(tuán)結(jié)合可能導(dǎo)致 N 端區(qū)域的構(gòu)象變化,使得抗體對(duì) LC3-II 的親和性更高,所以 LC3-II 條帶顯色深并不能代表該樣本處于高自噬狀態(tài)。另外,LC3-I 對(duì)反復(fù)凍融更為敏感,也更易在 SDS 上樣緩沖液中降解;谝陨蟽蓚(gè)原因,在半定量時(shí),除了使用 LC3-II/LC3-I 的比值外,也有科學(xué)家使用 LC3-II 與管家蛋白(Housekeeping Protein)的比值進(jìn)行半定量。

4.LC3是膜相關(guān)蛋白,在細(xì)胞裂解后,對(duì)其進(jìn)行冰上短暫超聲,促進(jìn)蛋白的溶解,將 LC3 從膜上解離。LC3-I 和 LC3-II 是小分子蛋白,雖然理論上LC3II分子量更大,由于帶負(fù)電的PE改變了LC3II的性質(zhì),使其疏水性更強(qiáng),導(dǎo)致其在電泳中遷移率更高。所以,LC3II電泳后停留在更小分子量(約14kDa)。

5.由于LC3-I 與 LC3-II 分子量小,又僅有 2 KD 差異,WB注意選用高濃度分離膠(約15%),轉(zhuǎn)膜使用0.22μm轉(zhuǎn)印膜,濕轉(zhuǎn)70V,1.5h或半干轉(zhuǎn)2.5A,7min。

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原創(chuàng)作者:武漢菲恩生物科技有限公司

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